O topônimo é homenagem póstuma a Osvaldo da Costa Nunes Freire, médico e político maranhense. Foi deputado Federal pelo Maranhão de 1967 a 1975 e Governador do Maranhão de 31 de março de 1975 a 15 de março de 1979. A indicação ao governo do Maranhão pelo partido do ex-senador Vitorino Freire de quem o grupo Sarney substituiu no governo. Sede no atual distrito de Governador Nunes Freire (ex-localidade de Encruzo). Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1997. Em divisão territorial datada de 2001, o município é constituído do distrito sede.
Segundo a UEMA, atraves dos alunos do PROCARD ANO DE 2002, que fizeram pesquisa de campo e obtiveram os resultados: que a criação do local iniciou na década de 1960, com a chegada dos primeiros moradores, vindos de várias partes do Maranhão e de outros estados como Pernambuco, Pará, Ceará, Piauí entre outros, atraídos pela fertilidade das terras. Eles foram desbravadores do povoado Encruzo, os mesmos vieram em busca de melhoria de vida para sua famílias.
Segundo moradores mais antigos o município iniciou sua formação mais precisamente em 1961, quando o morador, senhor Pedro Pitomba e sua família chegaram por estas terras, implantando um pequeno engenho de cana-de-açúcar. O Pioneiro construiu sua casa de taipa coberta de cavacos, como a maioria das primeiras casas. No de 1965 foi instalada e posta em funcionamento a linha de trafego que ligava a baixada maranhense e o estado do Pará uma encruzilhada na BR 316 o que levou o senhor Sebastião Araújo da Silva(conhecido como sebastiao roxo) segundo seu próprio relato, batizar o lugar com o nome de Encruzo foi também quem plantou a primeira roça no povoado onde hoje é o bairro JK (o belenzinho).
O movimento pela emancipação de Encruzo teve inicio nos anos 90 e teve como principais líderes, deputado Carlos Braide, Nonato Holanda, Brênio josé de Almeida, entre outros. Em 19 de Junho de 1994 aconteceu uma consulta plebiscitária, a qual constatou que 100% da população estavam a favor da emancipação política do município.
Conforme o Diário Oficial, Encruzo foi emancipado numa quinta-feira, 10 de novembro de 1994, pela Lei Estadual n. 6.174 recebendo o nome de Governador Nunes Freire, pertencente à mesorregião oeste maranhense, na microrregião do Gurupi.
Sem informações até o momento
Elevado á categoria de município e distrito com a denominação de Governador Nunes Freire, pela Lei Estadual nº 6174 de 10 de novmbro de 1994, desmembrado do município de Cândido Mendes.
Sede no atual distrito de Governador Nunes Freire (ex-localidade de Encruzo).
Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1997.
Em divisão territorial datada de 2001, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2007. O município está em intensa conurbação com a cidade vizinha Maracaçumé. Sua população de acordo com o censo 2016 é de 25.052. Localizado na BR 316, a aproximadamente (95 km) da fronteira com o Pará, seu clima equatorial quente-úmido seco e sofre grande influência da região amazônica, tendo como bacia a dos rios Macaxeira e do Maracaçumé. O grande contraste em Governador Nunes Freire são as serrarias legalizadas que impulsionam o comércio local gerando empregos de forma direta e indiretamente indo de encontro às operações da PRF combatendo crimes como a extração ilegal da madeira. Além de outros como: o tráfico de animais silvestres na região do Gurupi, a preservação das terras indígenas Ka'apor e combate ao desmatamento da Amazônia maranhense.[5]
O clima equatorial quente-úmido sofre influência da região amazônica e das bacias dos rios Macaxeira e Maracaçumé. A principal atividade econômica ainda é a exploração da madeira e as serrarias legalizadas. A agricultura é de subsistência, predominando as culturas de arroz, feijão, além da mandioca e do açaí e criação de aves e bovinos. Na pesca os peixes são criados na zona rural em açudes. A indústria é a formada por usinas que se beneficiam da cultura do arroz e de madeira abundante na região. O comércio oferece produtos, e medicamentos, naturais e alimentícios, armarinhos públicos e particulares.
